Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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