Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms