Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HNF4GQ14541 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms