Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CKAP5Q14008 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CKAP5Q14008 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CKAP5Q14008 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CKAP5Q14008 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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