Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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