Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms