Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CUL3Q13618 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CUL3Q13618 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CUL3Q13618 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CUL3Q13618 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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CUL3Q13618 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CUL3Q13618 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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