Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms