Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TOP3AQ13472 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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