Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SP140Q13342 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SP140Q13342 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SP140Q13342 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SP140Q13342 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SP140Q13342 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SP140Q13342 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP140Q13342 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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