Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLAMF1Q13291 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLAMF1Q13291 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms