Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms