Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K1Q13233 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms