Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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