Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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