Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPRL3Q12980 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms