Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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