Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CNTN1Q12860 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNTN1Q12860 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNTN1Q12860 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNTN1Q12860 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNTN1Q12860 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNTN1Q12860 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CNTN1Q12860 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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