Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms