Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA3Q08378 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms