Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms