Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PAX8Q06710 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms