Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CD164Q04900 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms