Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms