Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms