Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms