Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms