Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms