Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD1P98174 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD1P98174 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD1P98174 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms