Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAE1P78406 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms