Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms