Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VBP1P61758 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VBP1P61758 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms