Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P61576 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P61576 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P61576 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P61576 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P61576 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P61576 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms