Protein–RNA interactions for Protein: P57086

SCAND1, SCAN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAND1P57086 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAND1P57086 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAND1P57086 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms