Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms