Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPAP53621 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPAP53621 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPAP53621 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms