Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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