Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPIAP49247 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPIAP49247 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms