Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM4P49221 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM4P49221 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM4P49221 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms