Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms