Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms