Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP5P45974 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP5P45974 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP5P45974 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP5P45974 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms