Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms