Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP62P37198 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP62P37198 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP62P37198 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms