Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms