Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms