Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APCP25054 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APCP25054 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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