Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms