Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms