Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFE3P19532 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFE3P19532 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TFE3P19532 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TFE3P19532 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFE3P19532 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFE3P19532 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFE3P19532 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFE3P19532 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFE3P19532 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms